Memorandum: 9月 2022

アップデートなので，すでにJuliaがインストールされている前提です．

Homebrewを使います．まずはターミナルから，以下のようしてJuliaをアップデートします．

% brew install julia --cask

以前は，以下のように cask install juliaだったのですが，エラーが出てしまいました．

% brew cask install julia

Error: `brew cask` is no longer a `brew` command. Use `brew <command> --cask` instead.

% brew cask install julia

アップデートが終わったら，Applicationフォルダに新しいJulia（以下の例では，最初に1.0がインストールされていて，新たに1.8をインストールした）のアイコンがあるので，アイコンをダブルクリックして立ち上げます．

その上で，"]"キーを押してパッケージモードに切り替えて，以下のように（add IJulia）IJuliaパッケージを追加します．

/Applications/Julia-1.8.app/Contents/Resources/julia/bin/julia ; exit;

% /Applications/Julia-1.8.app/Contents/Resources/julia/bin/julia ; exit;

_ _ _(_)_ | Documentation: https://docs.julialang.org

(_) | (_) (_) |

_ _ _| |_ __ _ | Type "?" for help, "]?" for Pkg help.

| | | | | | |/ _` | |

| | |_| | | | (_| | | Version 1.8.1 (2022-09-06)

_/ |\__'_|_|_|\__'_| | Official https://julialang.org/ release

|__/ |

(@v1.8) pkg> add IJulia

この↑例では省略していますが，add IJuliaを実行すると，ずらずらとインストールが始まります．

IJuliaパッケージの追加が終わった段階で，Available kernelsを確認すると，julia-1.8 が現れます．

% jupyter kernelspec list

Available kernels:

julia-1.0 /Users/hide/Library/Jupyter/kernels/julia-1.0

julia-1.8 /Users/hide/Library/Jupyter/kernels/julia-1.8

python3 /usr/local/share/jupyter/kernels/python3

Jupyter Notebookを立ち上げて，インストールしたJuliaを使えるかどうか確認しておきます．

Julia（今回は1.8.1）が使えるようになっていれば成功です．

使わないカーネルや，存在しないカーネル（今回の例では，Julia 1.0.5）を削除するにはターミナルから以下のように入力します．なお，"KERNEL_NAME"には使わなくなった，もしくは存在しないカーネルの名前を書きます．

% jupyter kernelspec uninstall KERNEL_NAME

今回の例で，julia-1.0を削除すると以下のようになります．

% jupyter kernelspec uninstall julia-1.0

Kernel specs to remove:

julia-1.0 /Users/xxx/Library/Jupyter/kernels/julia-1.0

Remove 1 kernel specs [y/N]: y

[RemoveKernelSpec] Removed /Users/xxx/Library/Jupyter/kernels/julia-1.0

今回の例では，Juliaを1.0から1.8にアップデートしました．1.0でインストールしたパッケージは継承されないようなので，改めて追加する必要があります．以下の例は，とりあえず追加しておいたパッケージ達です．

(@v1.8) pkg> add CSV
(@v1.8) pkg> add Combinatorics
(@v1.8) pkg> add DataFrames
(@v1.8) pkg> add Distributions
(@v1.8) pkg> add JuMP
(@v1.8) pkg> add Plots
(@v1.8) pkg> add PyCall
(@v1.8) pkg> add PyPlot
(@v1.8) pkg> add RDatasets
(@v1.8) pkg> add StatsBase
(@v1.8) pkg> add StatsPlots
(@v1.8) pkg> add SumOfSquares
(@v1.8) pkg> add Statistics
(@v1.8) pkg> add Gadfly
(@v1.8) pkg> add LinearAlgebra
(@v1.8) pkg> add Optim

インストールしたパッケージを確認するには，以下のように"status"コマンドを実行します．

(@v1.8) pkg> status

Status `~/.julia/environments/v1.8/Project.toml`

[336ed68f] CSV v0.10.4

[861a8166] Combinatorics v1.0.2

[a93c6f00] DataFrames v1.3.5

⌅ [31c24e10] Distributions v0.23.4

[c91e804a] Gadfly v1.3.4

[7073ff75] IJulia v1.23.3

[4076af6c] JuMP v1.3.0

[5424a776] Mamba v0.12.5

[429524aa] Optim v1.7.2

[91a5bcdd] Plots v1.32.1

[438e738f] PyCall v1.94.1

[d330b81b] PyPlot v2.11.0

[ce6b1742] RDatasets v0.7.7

[2913bbd2] StatsBase v0.33.21

⌃ [f3b207a7] StatsPlots v0.15.1

[4b9e565b] SumOfSquares v0.6.2

[37e2e46d] LinearAlgebra

[10745b16] Statistics

Info Packages marked with ⌃ and ⌅ have new versions available, but those with ⌅ cannot be upgraded. To see why use `status --outdated`

Memorandum

2022年9月14日水曜日

Juliaで作って学ぶベイズ統計学のコードを実行してみました

2022年9月10日土曜日

JuliaをアップデートしてJupiter Notebookでも使えるようにする